はい、原因は特定できていませんが、現時点で見つかったことを共有します。
このエラーは、すべてのプラグインを有効にしたセーフモードでも発生し、テーマを無効にしても発生します。これは、ストック（標準）インストール自体にバグがあるという意味ではありません。おそらく、いずれかのプラグインが重複したタグをデータベースに追加し、そのタグがそのまま残って、プラグインが無効化されても問題を引き起こしている可能性が高いです。
修正のため、重複したタグを検索して別のものに変更しています（例：‘web-dev’ を ‘webdev’ に変更）。
いくつかのタグは「投稿」として設定されているのにリストに表示されていないことに気づきました。そのため、サイトは「web-dev」タグが12件残っていると表示しますが、検索機能ではそれらを見つけることができません。
多くの投稿では、タグ入力欄に同一のタグが重複して入力されており、一方を削除するともう一方も削除されてしまいます。
現時点での最良の推測ですが、問題を引き起こしているタグは投稿本文内にもリンクとして埋め込まれているようです。つまり、投稿の本文に #web-dev と入力するとタグが生成され、そのタグがすでに投稿タイトルに含まれている場合、重複が生成されるのではないかと思われます。
この現象を意図的に発生させて観察しようとしています。
しかし、他にも何か起きているようです。こちらの検索結果を見ると、一番上の投稿にはすでに ‘web-dev’ という文字が含まれていないはずなのに（変更済み）、検索機能はどこかにあると認識しています。
編集：最後の部分は無視してください。検索機能が賢く反応していただけでした。こちらの検索（