@Ed_S Empurrei um patch na semana passada (29 de outubro) que deve corrigir esse problema. O problema era que, toda vez que você fazia uma atualização pela interface web, um worker do unicorn se forkava três vezes e esses processos forkados nunca morriam. Esse bug e o relatado aqui estão conectados e devem estar corrigidos agora.
Sua instância já deve ter a correção, então você não deverá ver workers extras do unicorn após atualizar pela interface de administração. Para eliminar os workers órfãos existentes, você pode usá-los kill -9 ou um reinício do container deve ser suficiente. Por favor, me avise se ainda observar esse problema em atualizações futuras.