100%互換ではない可能性が非常に高いです。Discourse互換性はどうですか？確認しましたか？ Configure an S3 compatible object storage provider for uploads をご覧ください。
バケットを切り替えるためにリマップを使用することについてのトピックがあります。
私がやるなら、新しいS3構成で新しいサーバーをセットアップし、SiteSettings.include_s3_uploads_in_backups を true に設定して、それが復元されるかどうかを確認します。