我知道这个帖子已经非常古老了，但我遇到了同样的问题，不得不进行一些调整才能让它正常工作。
问题是，我通过运行 ./launcher logs app 检查后发现，洋葱模板从默认站点复制了大量内容，问题在于其中一些设置是重复的。
我不得不使用 ./launcher enter app 登录到容器中，然后编辑 /etc/nginx/conf.d/onion.conf 文件，删除 proxy_buffer_size 8k; 这一行。
此外，我还需要在 nginx.conf 文件中添加 server_names_hash_bucket_size 64;。
这样做之后服务器又恢复正常了，我是通过查看日志找到这个解决方案的。