Wie ich (korrekterweise) bereits sagte, verwendet diese Instanz (derzeit?) S3 nur für Backups und nicht für Uploads.
Es sind die Backups von 2 von 3 Sub-Sites, die im Stammverzeichnis des Backup-Buckets abgelegt werden. Die Hauptseite verschiebt sie wie erwartet nach default, und eine der Multisite-Instanzen verschiebt sie in das Verzeichnis sitename.