Ahhh, eu não sabia que havia logs lá também 
obrigado por apontar!
Tem muita coisa acontecendo ali, parece que os certificados estavam sendo renovados a cada rebuild? porque há um monte de coisas de renovação acontecendo. E o @helmi está certo, acho que é este aqui que você quer dizer:
[Sat 25 Jan 2020 06:48:31 PM UTC] Create new order error. Le_OrderFinalize not found. {
“type”: “urn:ietf:params:acme:error:rateLimited”,
“detail”: "Error creating new order :: too many certificates already issued for exact set of domains: $
“status”: 429
então… como eu passo por isso?
edit: de acordo com a letsencrypt:
Se você atingiu um limite de taxa, não temos como redefini-lo temporariamente. Você precisará esperar até que o limite de taxa expire após uma semana.
e então eu encontrei Rate Limits - Let's Encrypt
então… acho que vou ter que esperar uma semana então…
edit2: eu verifiquei em https://crt.sh/ e só vejo 10 certificados na última semana? não 50…
pergunta: quando é que considera um certificado uma renovação? só quando um rebuild app, eu suponho?