Você já tentou várias vezes, fez várias reconstruções e talvez o DNS não esteja apontando para o seu servidor? Minha suspeita é que você solicitou um certificado várias vezes e ele falhou devido a um erro de DNS ou proxy intermediário, e agora você precisará esperar uma semana. Você pode tentar um subdomínio diferente ou adicionar um segundo endereço ao certificado (não importa qual seja), como descrito em Configurar Let’s Encrypt com vários domínios / redirecionamentos.
Você executou ./discourse-setup? Ele passou no teste de DNS no início?