おそらく、マージしようとしているユーザーがフォーラムで多くのアクティビティを持っていることが原因だと思います。このような場合、UI 経由でのユーザーマージはタイムアウトする可能性があります。これは既知の問題であり、修正を計画しています。
その場合、サイトのバックエンドから rake users:merge タスクを実行してユーザーをマージする必要があるかもしれません。その方法の詳細は、こちらをご覧ください：https://meta.discourse.org/t/rake-task-for-merging-users/89086。