Não acho que haja muito que o Cloudflare possa fazer automaticamente. Existem instruções para permitir o Rocket Loader na CSP. No entanto, o JavaScript do Discourse já é altamente otimizado, então o Rocket Loader não é necessário.
Se você acessar as configurações do seu Cloudflare, deverá ser possível desativar especificamente o Rocket Loader. Em seguida, você pode reativar o proxy e os erros de CSP devem desaparecer.
Para a maioria dos usuários, é mais fácil desativar o Cloudflare completamente, mas se você realmente precisar da proteção contra DDoS, pode configurá-lo seguindo as instruções aqui: Full site CDN acceleration for Discourse