답변보다는 추가 의견 정도로 말씀드립니다… 
저는 플러그인이 많이 설치된 1GB 용량의 DigitalOcean 테스트 사이트를 운영하고 있어서 평소에도 속도감이 가장 빠른 편은 아닙니다. 하지만 최근에는 이전보다 훨씬 더 오래 걸리는 것 같고, 며칠 전에는 @MarcP 님과 같은 방식으로 이상한 현상에 걸려서 리셋을 해야 했습니다.
이전까지는 시간을 재본 적이 없지만, 오늘 '모두 업데이트’를 설정하고 버튼을 클릭한 시각을 기록해 두었습니다. 오전 9시 30분에 시작했는데, 아직 오전 10시 15분까지 진행 중입니다. 현재 일부 자산을 번들링하고 있습니다. 평소에는 45분 이상 걸리지 않는다는 점은 꽤 자신 있게 말씀드릴 수 있습니다.
다만 임시 파일을 삭제하는 과정에서 권한 관련 문제가 있었던 것처럼 보이는데, 이것이 관련이 있는지 확실하지는 않습니다.