システムメッセージがユーザーノートに追加される動作は、ユーザーノートプラグインのデフォルト機能であり、現在、min first post typing time システムのトリガーなど、システム生成のノートを抑制するための特定のサイト設定やトグルはありません。
これに対する手動の回避策は、システム生成のノートを定期的にクリーンアップまたは削除することです。このユーザーノートレポートのようなデータエクスプローラークエリを使用して、削除したいユーザーノートを特定できます。
それを念頭に置いて、ユーザーノートからのシステムメッセージを無効にする機能に興味がある場合は、Metaコミュニティで#featureトピックを作成することをお勧めします。その機能に興味を示す人が多ければ多いほど、Discourseに実装される可能性が高くなります。