Gostaria de saber para que serve este arquivo /var/www/discourse/vendor/data/RT_sRGB.icm?

Pode ser mais fácil gerenciar se você criar um link simbólico dos arquivos GeoIP em /var/www/discourse/vendor/data para uma montagem separada contendo arquivos GeoIP do host, assim você não precisa se preocupar com mais nada nesse diretório.