アップグレード中にマシン全体がフリーズ

@Jagster @uwe_keim これらのコマンドの出力を報告していただけますか

cat /proc/sys/vm/overcommit_memory 
cat /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/enabled 

私のシステムでは以下のようになっています

# cat /proc/sys/vm/overcommit_memory 
1
# cat /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/enabled 
always madvise [never]