Я рекомендую перенести всё на новую виртуальную машину, развернуть новый экземпляр Discourse с пустой базой данных (при желании скопировав каталоги ssl и letsencrypt для обеспечения переключения без простоя) и восстановить текущую базу данных на новый сервер. Это позволит выполнить обновление без простоя и с нулевым риском возникновения ошибок.
В любом случае, скорее всего, уже пора обновить вашу операционную систему.