Pode ser útil manter seus uploads, ou, digamos, /var/discourse/shared/web_only em armazenamento de rede. Você precisa editar o arquivo yml para apontar para ele em vez de usar um link simbólico (o link simbólico não funciona porque o contêiner não consegue acessar o local para o qual seu link simbólico aponta).
Então, se você mudar para uma nova VM, poderá apenas remontar esse armazenamento de rede em vez de copiá-lo.
Não recomendo armazenamento de rede para o banco de dados, pois é mais lento.