何が起きたかと言えば、証明書を取得しようとして繰り返しリクエストを送った結果、Let’s Encrypt のレート制限に達してしまったということですね。これは「SSL がドメインをブロックした」というのとは意味が異なります。
別の SSL 証明書プロバイダー(有料)を使用するか、レート制限が解除されるのを待つこともできます。これは、無料サービスをすべてのユーザーが利用できるようにするための方針です。
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