どのように壊れるのか説明していただけますか?この値の引用符の有無は違いを生みません。
[2] pry(main)=> YAML::load("env:\n DISCOURSE_BASE_URL: 'https://discourse.example.com'")
=> {"env"=>{"DISCOURSE_BASE_URL"=>"https://discourse.example.com"}}
[3] pry(main)=> YAML::load("env:\n DISCOURSE_BASE_URL: https://discourse.example.com")
=> {"env"=>{"DISCOURSE_BASE_URL"=>"https://discourse.example.com"}}