J’ai eu la même chose. Malheureusement, il m’a fallu un moment pour repérer l’erreur et, dans le processus de mise à niveau, j’ai semblé corrompre ma base de données Postgres 
Il est donc certainement préférable de suivre la suggestion de reconstruire directement à partir de la CLI.
Modifier :
J’ai pu restaurer une ancienne sauvegarde après avoir réinitialisé le journal des transactions postgres. Heureusement, il ne s’agissait pas d’un site de production - c’était déjà assez désagréable pour un site de test.