通知設定は何も変更していません。通知アイコンは、引用とメンションでは異なります。通知メニューに@が表示された場合、優先度を高くしています。
とはいえ、引用している人が関与していない場合や、現在の会話に引き込む必要がない場合には、過度に引用しないように注意しています。
それが迷惑だと知ってよかったです！やめますね。 
それは興味深い点ですね。その点については考えていませんでしたし、解決策があるのかどうかもわかりません。フルユーザー名を記載し、バッククォートで囲むのが良いのではないでしょうか？例えば @moin のように。