¿Te refieres a los bordes en general? En un tema puedes editar muchos con un poco de CSS:
:root {
--content-border-color: red; // bordes generales
}
.sidebar-wrapper {
--d-sidebar-section-border-color: blue; // divisores de la barra lateral
}
Actualmente, en los estilos de Discourse hay variables como estas que pueden sobrescribirse en el CSS de un tema, con el propósito de facilitar un poco cambios específicos como este. Puedes encontrarlas usando la herramienta de inspección de tu navegador.
Este tipo de cambios individuales por elemento no es realmente para lo que estaba diseñado el área de administración de la paleta de colores (tendríamos que añadir docenas de opciones para cubrir todo de forma individual), así que el CSS personalizado es realmente la mejor opción.