Potresti offrire gruppi a cui l’utente può unirsi e usare CSS Classes for Current User's Groups.
Oppure l’utente può usare un plugin del browser per cambiare il CSS solo per sé. Io uso Stylus per personalizzare la mia esperienza su Meta.
Il composer era un esempio casuale? O cosa vuoi offrire oltre a “Usa il font monospace in modalità Markdown del composer”, che può essere abilitato o disabilitato nelle preferenze?