Não sei o que você está propondo, mas encontrei este artigo que parece dizer que os anúncios responsivos agora podem ignorar seus contêineres.
…unidades de anúncio responsivas agora podem redimensionar o contêiner pai HTML (por exemplo,
<div>) em que estão inseridas. Isso permite que se adaptem automaticamente a todos os diferentes tamanhos de anúncio nas páginas dos editores.Observe que, para que as unidades de anúncio responsivas funcionem corretamente, elas não devem ser colocadas dentro de um contêiner com altura fixa ou limitada.
Legal. 
Se quiser limitar a altura dos seus anúncios responsivos, precisará modificar o código do anúncio responsivo…
<ins class="adsbygoogle" style="display:inline-block;min-width:400px;max-width:970px;width:100%;height:90px"
Então, faça o mesmo que antes funcionava com contêineres e CSS, mas use estilos em linha para permitir que o Google “se adapte automaticamente a todos os diferentes tamanhos de anúncio” — seja lá o que isso signifique.
MAS os exemplos deles mostram que usar CSS ainda deve funcionar: @ljpp veja este artigo:
Tem certeza de que não tentou usar CSS para controlar a largura/altura máxima das unidades responsivas? Os dois artigos se contradizem, então talvez os exemplos deles estejam desatualizados.