Non sono del tutto sicuro di cosa causi questo, ma sembra che sia probabilmente correlato a Themeable site settings are now available
Quale tema stai usando? Come sono configurate queste impostazioni per il tema?
Penso che se hai impostato search field in site header e questo componente è installato, finisci nello stato che descrivi in cui la ricerca è solo nel banner e non appare affatto nell’intestazione… ti sembra accurato?