Hola Dan,
¿Parece que la salida de tu plugin Search Banner está en el valor predeterminado above-main-container? Creo que necesitas cambiar esto para colocar el Search Banner fuera del #main-outlet 
Sin embargo, el tema tiene un estilo personalizado de chat cuando está habilitado en el #main-outlet, que creo que solo necesita estar activo en las páginas de chat.
Esto está agregando el fondo con !important al #main-outlet, lo que anula la transparencia del fondo del tema en #main-outlet, etc…
Creo que esto sería mejor si se restringiera a .has-full-page-chat para que solo aparezca en las páginas de chat.
Con la configuración above-main-container
Con la configuración below-site-header
