No, si siguió Configurar un proveedor de almacenamiento de objetos compatible con S3 para cargas. Si tiene la configuración en la base de datos, podría ser más complicado si intenta una restauración en lugar de rsync.
Moverse a una nueva instancia es de bajo riesgo, ya que puede simplemente volver a cambiar DNS a su sitio deshabilitado, pero si no tiene acceso a DNS y a DigitalOcean, estará atascado.
Parece que quizás se olvidó de citar algo con el comando de inicio. Parece que eso es lo que querría hacer.
Buena suerte