Lo siento, quise responder a eso y se me pasó.
Actualmente se eliminan permanentemente[1] después del período de retención. 
Para eliminaciones individuales de mensajes o canales de chat, inicialmente se eliminan de forma lógica[2], y estamos agregando la parte que los eliminará permanentemente junto con los demás una vez que finalice el período de retención.
(Pequeña nota: Aunque los canales se eliminan inicialmente de forma lógica, actualmente no hay forma de recuperarlos una vez que desaparecen. Está en el plan, pero aún no se ha programado)