É prática comum configurar um subdomínio diferente se você deseja manter os e-mails separados. O sistema de e-mail interno do Discourse pode funcionar com um domínio completamente diferente daquele onde ele está hospedado. Por exemplo, eu tenho o Discourse em forums.tld.com e o e-mail em mail.tld.com. Isso permite que meu servidor de e-mail principal em tld.com permaneça independente do gerenciamento de e-mails do Discourse.
Acabamos de migrar do modelo POP3 para o modelo de receptor de e-mail. A instalação foi muito simples e funciona muito melhor.