De acuerdo, hice esto:
cd /var/discourse
./launcher enter app
rails c
Luego
UserOption.where.not(dark_scheme_id: nil).find_each do |uo|
uo.update(dark_scheme_id: nil)
end
¡Funcionó!
Ahora, cuando ejecuto el script del explorador de datos, no hay resultados. También lo confirmé al abrir las preferencias de un usuario > interfaz para ver si está marcado y sí, ahora está marcado.
Gracias por tu ayuda 