Como alguém que passa uma quantidade insana de tempo apoiando administradores de sistemas iniciantes, acho que isso aumenta muito a complexidade. É necessário um trabalho enorme para dar suporte a apenas uma configuração super simples e à prova de falhas. Até gerenciar uma instalação de dois contêineres e saber substituir app por web_only (para não mencionar saber como e quando atualizar o contêiner de dados) aumenta a complexidade pelo menos em quatro vezes.
Isso, eu acho, é a grande vantagem.