Encontrei outro erro.
Se eu usar o slug pr-and-social-media, o plugin procurará por ‘pr’, ‘and’, ‘social’, ‘media’ e, se encontrar algum deles, adicionará a um grupo de categorias.
Ele está usando ‘-’ como divisor, o que pode ser um recurso, se você quisesse permitir que sites tivessem subgrupos de categorias.
Estou apenas removendo todos os hífens de todos os slugs das minhas categorias para corrigi-lo.