Ich glaube, was sie vorschlagen, ist, dass, wenn ein Plugin, das bereits mit dem Kern gebündelt war, in app.yaml aufgeführt wäre, es einfach ignoriert würde. Mit einer Benachrichtigung, dass die Aufnahme in app.yaml redundant war und der Eigentümer sie entfernen könnte.
Auch ich finde es ein wenig ärgerlich, dass ich, solange ich Plugins in meiner app.yaml aufgeführt habe, immer das Risiko eines fehlgeschlagenen Updates eingehe. Jedes Mal, wenn ich das Update durchführe, muss ich also überprüfen, ob eines meiner Plugins in den Kern aufgenommen wurde.