En el lado del cliente, Discourse no sirve ningún activo de javascript para los plugins deshabilitados, por lo que no habrá ningún impacto allí.
En el lado del servidor, para los plugins implementados correctamente (que todos estos lo son), las personalizaciones de los plugins se omiten cuando están deshabilitados. Así que sí, técnicamente podría haber una ligera sobrecarga para verificar el estado habilitado/deshabilitado, pero debería ser minúscula.
Los plugins que estamos fusionando aquí son los que ejecutamos en cada instancia de Discourse en nuestro hosting discourse.org. Por lo tanto, todos están muy bien probados a escala.