こんにちは、@technoshaman :wave! 私も Obsidian ユーザーです。
Discourse API を使えば、技術的には何でも可能です。UI でできることは、API でも実現できます。
Obsidian との連携についてお尋ねですが、Publish 機能のことでしょうか、それともバウルト内のファイル群のことでしょうか？新しいプラグイン API を使って、いくつかの API 呼び出しを組み込むことができるかもしれません。
参考になりそうなリソースをいくつかご紹介します。
Discourse API のリバースエンジニアリング方法
Discourse API ドキュメント
また、API の使用例もいくつか紹介します。
Discourse API Ruby Gem の使い方
Zapier で Discourse API にリクエストを送る方法