Se detiene en seco. No te lo habrías perdido. Mi suposición es que resolviste inteligentemente el problema con /etc/hosts, lo que satisfizo al script, pero no permitió que Let’s Encrypt obtuviera un certificado. discourse-setup es un script de shell y está diseñado para los usuarios más novatos, por lo que sus pruebas son bastante ingenuas.
¿Quizás ver el tema de instalación estándar?
EDITAR: Bueno, no hay mucho allí.
¿Qué consejo de solución de problemas quieres añadir? Creo que hay algunas pistas allí. Suponer que alguien creará una entrada en /etc/hosts y omitirá la verificación de DNS es algo que nunca he oído que nadie haga. 