Non è “Invece di”: .panel-body è una classe che seleziona tutti i corpi dei pannelli, mentre .hamburger-panel seleziona, beh, il pannello hamburger.
Quindi non so cosa sia cambiato specificamente nel core che abbia rotto il tuo codice precedente. Ma se vuoi nascondere tutte le sottocategorie dal menu hamburger, questo mi sembra il metodo più diretto:
.hamburger-panel .category-link.subcategory {
display: none;
}