この目的には、事前にシードされた Contribute > Site feedback カテゴリを使用することが期待されていると思います。その説明は以下の通りです。「このサイト、その構成、仕組み、そして改善方法に関する議論」。
興味深いアイデアですね。通常のトピックでユーザーが変更を提案するのと比べて、どのようなメリットがあるのでしょうか?目標は、サイトの構成に対して行われた変更を時系列で追跡できる仕組みを作ることでしょうか?
サイト設定、カテゴリ、タグ、ポリシーなどは、Discourse API を使って構成できます。Git リポジトリ内で API を介してサイトの構成を管理するスクリプトを作成することも可能かもしれません。そのスクリプトは、リポジトリ上の PR がマージされた際に実行するようにできます。私の視点からは、UI を通じてサイトの構成を手動で変更するよりも難しそうですが。