No necesitas hacer nada; Discourse se encarga de esto automáticamente. Sidekiq y Redis ejecutarán el trabajo solo una vez, y Sidekiq tomará solo uno de los contenedores web, pero no creo que puedas estar seguro de cuál será en cualquier copia de seguridad específica si estás usando copias de seguridad locales.
Por lo tanto, deberías usar un bucket S3 externo si aún no lo haces; de lo contrario, es probable que tus archivos de copia de seguridad se almacenen aleatoriamente en los discos locales de ambos contenedores. Usar un bucket S3 significa que tu copia de seguridad siempre se guardará en el mismo lugar.