Problema resolvido, tive que garantir que os cabeçalhos estivessem formatados corretamente com dois pontos em vez de um sinal de igual.
Tentei olhar o script de importação mbox, mas ele parece estar faltando um monte de coisas, como observado neste post:
De qualquer forma, eu queria brincar de criar os IDs de usuário (o mailman não os usa) porque o que estou fazendo é importar 20 anos de arquivos e muitos desses usuários não estão mais por perto ou estão usando endereços de e-mail diferentes. Já tenho cerca de 700 usuários do sistema antigo no banco de dados agora, adicionar 100.000 posts pode apresentar outros problemas.
Removi o campo staged=true, ele não parecia estar funcionando de qualquer forma.
Levei uma noite para escrever algumas ferramentas PHP que analisaram todos esses arquivos Mailman pipermail e construíram um conjunto de IDs de usuário, o que não foi tão ruim.