Admin → Customize → User Fields からそれらのフィールドを作成した場合、次のように渡す必要があります。
$parameters = array(
'nonce' => $nonce,
'external_id' => 'jay',
'email' => 'bugsbunny@betaclub.org',
'username' => 'bugsbunny@betaclub.org',
'name' => 'Bugs Bunny',
'add_groups' => 'state_sponsors',
'custom.user_field_1' => 'Pro',
'custom.user_field_2' => 'FL',
);
フィールド名はUIで設定した名前ではなく、user_field_NUMBER という名前の番号付きフィールドになります。