Solo per confermare, stai utilizzando il toggle Light/Dark nel core o il vecchio Theme component?
Inoltre ci sono loghi chiari e scuri per desktop e mobile.
Se sei su mobile potresti dover caricare i 2 loghi nella sezione logo mobile di quella pagina nella tua immagine. Se non sbaglio; se nessun logo è caricato, verrà utilizzato il logo principale (il primo nella tua immagine) per i loghi non caricati.