Das sollte common/color_definitions.scss sein.
Und in common.css sind die Fallback-Werte identisch mit dem Anfangswert, sodass du einfach Folgendes verwenden kannst:
.nav-pills>li>a:hover {
background-color: var(--custom-nav-pills-bg);
&:not(.active) {
color: var(--custom-nav-pills);
}
}