La prima riga è fatal: not a git repository (or any parent up to mount point /), il che significa che in qualche modo hai corrotto il repository git che si trova nella cartella /var/discourse quando un utente segue la guida di installazione ufficiale.
Devi sistemare questo. Il modo in cui è corrotto significa che ti mancano aggiornamenti, e quindi cose che si presuppone siano lì non ci sono e tutto si rompe.