A primeira linha é fatal: not a git repository (or any parent up to mount point /), o que significa que você de alguma forma quebrou o repositório git que está na pasta /var/discourse quando um usuário segue o guia de instalação oficial.
Você precisa consertar isso. A forma como está quebrado significa que você está com falta de atualizações, e então coisas que se assume que estão lá não estão e tudo se quebra.