La versión de Ghost de Markdown es totalmente compatible con CommonMark con algunas otras características útiles como notas al pie.
<mark>Resaltado</mark> siendo una de las “pocas otras”.
<mark>Resaltado</mark> siendo una de las "pocas otras".
Puedes intentar empaquetar GitHub - markdown-it/markdown-it-mark: <mark> tag plugin for markdown-it markdown parser · GitHub como un plugin utilizando Developer's guide to Markdown extensions.