No estoy seguro de que esto sea lo que quieres decir, pero hay un mixin que puedes usar en tu CSS que permite 2 variables y elegirá según el modo que esté activo.
Ejemplo:
color: light-dark(#ffffff, #000000);
Aparte de eso, también existen las paletas de colores predefinidas en tu archivo about.json
Ejemplo del tema air:
"color_schemes": {
"air-light": {
"primary": "1c1c1c",
"secondary": "f9fcff",
"tertiary": "3877e5",
"quaternary": "7e8b93",
"header_background": "f9fcff",
"header_primary": "122b43",
"highlight": "e6cb37",
"danger": "d05454",
"success": "71bd9f",
"love": "c16ad7",
"selected": "e1ebfb"
},
"air-dark": {
"primary": "e0e0e0",
"secondary": "2d2d2d",
"tertiary": "9a5cfd",
"quaternary": "71bd9f",
"header_background": "202020",
"header_primary": "e0e0e0",
"highlight": "9a5cfd",
"danger": "d05454",
"success": "71bd9f",
"love": "c16ad7",
"selected": "2f0177",
"hover": "535353"
}
},