Al momento non è possibile, a meno che tu non sovrascriva questo metodo in un plugin personalizzato.
L’obiettivo è rendere questa opzione configurabile dagli amministratori del sito, ma sto attendendo che il team di Chromium corregga questo bug prima di procedere: https://bugs.chromium.org/p/chromium/issues/detail?id=1091612&q=component%3AUI>Browser>WebAppInstalls&can=5.