Si ha configurado Configurar un proveedor de almacenamiento de objetos compatible con S3 para cargas y ha movido sus cargas locales a S3, entonces sus cargas están allí. No se copian de seguridad porque se asume que S3 tiene copias de seguridad y descargarlas es costoso y generalmente innecesario.
Si necesita sacarlas de S3 (como si estuviera alojado en discourse.org y se mudara a otro alojamiento), entonces necesita una copia de seguridad que incluya los archivos almacenados en S3.
¿Por qué quiere descargar sus archivos de S3?
Sí, parece que está fallando al descargar los archivos de S3. Supongo que no descargó ninguno, aunque es posible que su disco esté lleno, tal vez (esperaría un error de disco lleno, ¿pero tal vez no?).