Sí, creo que la mejor solución por ahora es agregar algunas verificaciones en el plugin de votación de publicaciones para omitir la lógica cuando las respuestas anidadas están habilitadas para un tema. Básicamente, hacer explícitamente que el plugin sea incompatible con las respuestas anidadas.
También sería genial tener un modo de «convertir a respuestas anidadas» para la votación de publicaciones. Supongo que habrá un porcentaje de usuarios de votación de publicaciones que simplemente querrán cambiar a respuestas anidadas.