Ну, это уже кое-что. 
Главное, чтобы вы чувствовали себя комфортно с такой страховкой и осознавали риски, связанные с экспериментами. Я тоже размещаю сервер самостоятельно, и это может быть довольно нервным, когда вы отклоняетесь от стандартного сценария без каких-либо указаний, особенно если у вас есть контент, который вам важен.
Не могли бы вы рассказать подробнее о вашей конфигурации и о том, как вы поддерживали свой сервер до сих пор? Возможно, это прольёт свет на то, как всё произошло, и кто-то из сообщества, кто сталкивался с подобной проблемой, узнает в этом свою ситуацию. Какой у вас сервер и какие у него характеристики? Вы упомянули, что следовали стандартному руководству по установке, но были не уверены в некоторых стандартных командах. Не пропустили ли вы важное обновление сервера или что-то ещё?