El único tema que pude encontrar con un problema similar fue Unable to login into discourse suddenly - #8 by Tarek_Khalil, y el consejo fue restaurar una copia de seguridad de antes del error de migración, lo que puede no ser la mejor opción en tu caso, ya que fue hace algún tiempo.
Me temo que los errores de base de datos están fuera de mi área de especialización. @pfaffman y @RGJ normalmente son muy buenos en esto (aunque no sé si es algo que hayan encontrado antes). ¿Tienen algún truco bajo la manga para esto?